Desde su comienzo su finalidad es dar a conocer los progresos alcanzados por la pedagogía. 

Actualmente es el único museo pedagógico en el mundo. 

Exposiciones

• Transitorias: Se desarrolla en el hall del museo y el objetivo de las mismas es ampliar la propuesta pedagógica buscando mostrar la evolución de la escuela y la sociedad uruguaya hasta hoy en día. 
• Permanentes: Muestran la evolución de la escuela en el país exhibiendo mobiliario, documentos, útiles escolares y pertenencias de instituciones y personajes de la educación. Además exhiben instrumentos específicos y colecciones completas de química, física, anatomía, botánica y zoología. 

Visitas: 

• Guiadas: se solicitan por teléfono o personalmente
• Libres: en cualquier momento dentro del horario 

Otros servicios: 

• Centro de documentación
• Cursos relacionados con pedagogía y didáctica 
• Taller de escritura "De la pluma a la XO" 
• Para los más pequeños rincón de disfraces 
• Valija didáctica: el museo va a las escuelas, con coordinación previa 

Se ha desarrollado un sitio web con una variedad de recursos educativos virtuales que permite visitar, conocer y jugar con el Museo Pedagógico. 

El museo se encuentra cerrado por reformas.